Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apba1B2RUJ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Apba1B2RUJ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apba1B2RUJ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms