Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprbB2RU80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PtprbB2RU80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms