Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zbed5B2RPU8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zbed5B2RPU8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms