Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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