Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trabd2bB1ATG9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trabd2bB1ATG9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trabd2bB1ATG9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms