Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4931406B18RikA2RSL7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4931406B18RikA2RSL7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4931406B18RikA2RSL7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931406B18RikA2RSL7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931406B18RikA2RSL7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931406B18RikA2RSL7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4931406B18RikA2RSL7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931406B18RikA2RSL7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931406B18RikA2RSL7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms