Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Svep1A2AVA0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Svep1A2AVA0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Svep1A2AVA0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Svep1A2AVA0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms