Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
4930402F06RikA2AUQ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930402F06RikA2AUQ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms