Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Patl2A2ARM1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Patl2A2ARM1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms