Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttll9A2APC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttll9A2APC3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttll9A2APC3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms