Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd60A2AMD2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd60A2AMD2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd60A2AMD2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms