Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc183A2AJB1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc183A2AJB1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms