Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm884A2A9H6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm884A2A9H6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm884A2A9H6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms