Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Shisal2aA2A9G7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisal2aA2A9G7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms