Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Prdm2A2A7B5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Prdm2A2A7B5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Prdm2A2A7B5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Prdm2A2A7B5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Prdm2A2A7B5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms