Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdr2lA2A6T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdr2lA2A6T1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdr2lA2A6T1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms