Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pabpc1lA2A5N3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpc1lA2A5N3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms