Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm27029A2A4P4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm27029A2A4P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm27029A2A4P4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms