Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms