Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY83

Pcdh7, Protocadherin 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh7A0A0A6YY83 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcdh7A0A0A6YY83 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdh7A0A0A6YY83 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcdh7A0A0A6YY83 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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