Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Larp1bA0A0A6YXJ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms