Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trbv23A0A0A6YWQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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