Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
1700019A02RikA0A087WPV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms