Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Uso1Q9Z1Z0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Uso1Q9Z1Z0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Uso1Q9Z1Z0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Uso1Q9Z1Z0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Uso1Q9Z1Z0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Uso1Q9Z1Z0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Uso1Q9Z1Z0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Uso1Q9Z1Z0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Uso1Q9Z1Z0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Uso1Q9Z1Z0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Uso1Q9Z1Z0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uso1Q9Z1Z0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Uso1Q9Z1Z0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Uso1Q9Z1Z0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Uso1Q9Z1Z0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Uso1Q9Z1Z0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Uso1Q9Z1Z0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uso1Q9Z1Z0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Uso1Q9Z1Z0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Uso1Q9Z1Z0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Uso1Q9Z1Z0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uso1Q9Z1Z0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Uso1Q9Z1Z0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Uso1Q9Z1Z0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Uso1Q9Z1Z0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Uso1Q9Z1Z0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uso1Q9Z1Z0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Uso1Q9Z1Z0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Uso1Q9Z1Z0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uso1Q9Z1Z0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Uso1Q9Z1Z0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uso1Q9Z1Z0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Uso1Q9Z1Z0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Uso1Q9Z1Z0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Uso1Q9Z1Z0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Uso1Q9Z1Z0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Uso1Q9Z1Z0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uso1Q9Z1Z0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Uso1Q9Z1Z0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uso1Q9Z1Z0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Uso1Q9Z1Z0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Uso1Q9Z1Z0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uso1Q9Z1Z0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Uso1Q9Z1Z0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uso1Q9Z1Z0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uso1Q9Z1Z0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Uso1Q9Z1Z0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Uso1Q9Z1Z0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Uso1Q9Z1Z0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Uso1Q9Z1Z0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Uso1Q9Z1Z0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Uso1Q9Z1Z0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Uso1Q9Z1Z0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Uso1Q9Z1Z0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Uso1Q9Z1Z0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Uso1Q9Z1Z0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Uso1Q9Z1Z0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uso1Q9Z1Z0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Uso1Q9Z1Z0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uso1Q9Z1Z0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uso1Q9Z1Z0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Uso1Q9Z1Z0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uso1Q9Z1Z0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Uso1Q9Z1Z0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uso1Q9Z1Z0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uso1Q9Z1Z0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uso1Q9Z1Z0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uso1Q9Z1Z0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uso1Q9Z1Z0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Uso1Q9Z1Z0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Uso1Q9Z1Z0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Uso1Q9Z1Z0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Uso1Q9Z1Z0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uso1Q9Z1Z0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Uso1Q9Z1Z0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Uso1Q9Z1Z0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uso1Q9Z1Z0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Uso1Q9Z1Z0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uso1Q9Z1Z0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uso1Q9Z1Z0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Uso1Q9Z1Z0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uso1Q9Z1Z0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Uso1Q9Z1Z0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Uso1Q9Z1Z0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Uso1Q9Z1Z0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Uso1Q9Z1Z0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Uso1Q9Z1Z0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Uso1Q9Z1Z0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uso1Q9Z1Z0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Uso1Q9Z1Z0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uso1Q9Z1Z0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Uso1Q9Z1Z0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms