Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Carm1Q9WVG6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carm1Q9WVG6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Carm1Q9WVG6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Carm1Q9WVG6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Carm1Q9WVG6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carm1Q9WVG6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Carm1Q9WVG6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Carm1Q9WVG6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Carm1Q9WVG6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Carm1Q9WVG6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Carm1Q9WVG6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Carm1Q9WVG6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carm1Q9WVG6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Carm1Q9WVG6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carm1Q9WVG6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carm1Q9WVG6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carm1Q9WVG6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carm1Q9WVG6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carm1Q9WVG6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carm1Q9WVG6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Carm1Q9WVG6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carm1Q9WVG6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Carm1Q9WVG6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carm1Q9WVG6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carm1Q9WVG6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carm1Q9WVG6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carm1Q9WVG6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carm1Q9WVG6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carm1Q9WVG6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carm1Q9WVG6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Carm1Q9WVG6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carm1Q9WVG6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carm1Q9WVG6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carm1Q9WVG6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carm1Q9WVG6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Carm1Q9WVG6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carm1Q9WVG6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Carm1Q9WVG6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Carm1Q9WVG6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Carm1Q9WVG6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Carm1Q9WVG6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Carm1Q9WVG6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Carm1Q9WVG6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Carm1Q9WVG6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Carm1Q9WVG6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Carm1Q9WVG6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carm1Q9WVG6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carm1Q9WVG6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carm1Q9WVG6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carm1Q9WVG6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carm1Q9WVG6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carm1Q9WVG6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carm1Q9WVG6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carm1Q9WVG6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Carm1Q9WVG6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carm1Q9WVG6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carm1Q9WVG6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Carm1Q9WVG6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Carm1Q9WVG6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Carm1Q9WVG6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Carm1Q9WVG6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Carm1Q9WVG6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Carm1Q9WVG6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Carm1Q9WVG6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Carm1Q9WVG6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Carm1Q9WVG6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Carm1Q9WVG6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Carm1Q9WVG6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carm1Q9WVG6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carm1Q9WVG6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carm1Q9WVG6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carm1Q9WVG6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Carm1Q9WVG6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Carm1Q9WVG6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Carm1Q9WVG6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Carm1Q9WVG6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Carm1Q9WVG6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Carm1Q9WVG6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Carm1Q9WVG6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Carm1Q9WVG6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Carm1Q9WVG6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Carm1Q9WVG6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Carm1Q9WVG6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.1 ms