Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aldh9a1Q9JLJ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Aldh9a1Q9JLJ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Aldh9a1Q9JLJ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Aldh9a1Q9JLJ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aldh9a1Q9JLJ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aldh9a1Q9JLJ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aldh9a1Q9JLJ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh9a1Q9JLJ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh9a1Q9JLJ2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh9a1Q9JLJ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh9a1Q9JLJ2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh9a1Q9JLJ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms