Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slc9a3r2Q9JHL1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc9a3r2Q9JHL1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc9a3r2Q9JHL1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc9a3r2Q9JHL1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc9a3r2Q9JHL1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc9a3r2Q9JHL1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a3r2Q9JHL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a3r2Q9JHL1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a3r2Q9JHL1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a3r2Q9JHL1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc9a3r2Q9JHL1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc9a3r2Q9JHL1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc9a3r2Q9JHL1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a3r2Q9JHL1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9a3r2Q9JHL1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a3r2Q9JHL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a3r2Q9JHL1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc9a3r2Q9JHL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc9a3r2Q9JHL1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3r2Q9JHL1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc9a3r2Q9JHL1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3r2Q9JHL1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc9a3r2Q9JHL1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a3r2Q9JHL1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc9a3r2Q9JHL1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc9a3r2Q9JHL1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3r2Q9JHL1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3r2Q9JHL1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc9a3r2Q9JHL1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc9a3r2Q9JHL1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc9a3r2Q9JHL1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc9a3r2Q9JHL1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms