Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tubb3Q9ERD7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tubb3Q9ERD7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb3Q9ERD7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tubb3Q9ERD7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb3Q9ERD7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tubb3Q9ERD7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb3Q9ERD7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb3Q9ERD7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubb3Q9ERD7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb3Q9ERD7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb3Q9ERD7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubb3Q9ERD7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubb3Q9ERD7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb3Q9ERD7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb3Q9ERD7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb3Q9ERD7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb3Q9ERD7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb3Q9ERD7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb3Q9ERD7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb3Q9ERD7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubb3Q9ERD7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubb3Q9ERD7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tubb3Q9ERD7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb3Q9ERD7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb3Q9ERD7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb3Q9ERD7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb3Q9ERD7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb3Q9ERD7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb3Q9ERD7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb3Q9ERD7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb3Q9ERD7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb3Q9ERD7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tubb3Q9ERD7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubb3Q9ERD7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb3Q9ERD7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb3Q9ERD7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubb3Q9ERD7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubb3Q9ERD7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb3Q9ERD7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb3Q9ERD7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb3Q9ERD7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb3Q9ERD7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb3Q9ERD7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb3Q9ERD7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb3Q9ERD7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb3Q9ERD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tubb3Q9ERD7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb3Q9ERD7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb3Q9ERD7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb3Q9ERD7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb3Q9ERD7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb3Q9ERD7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb3Q9ERD7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb3Q9ERD7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb3Q9ERD7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb3Q9ERD7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb3Q9ERD7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb3Q9ERD7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb3Q9ERD7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb3Q9ERD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb3Q9ERD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb3Q9ERD7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb3Q9ERD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb3Q9ERD7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb3Q9ERD7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb3Q9ERD7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb3Q9ERD7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tubb3Q9ERD7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb3Q9ERD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb3Q9ERD7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tubb3Q9ERD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubb3Q9ERD7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms