Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smdt1Q9DB10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smdt1Q9DB10 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smdt1Q9DB10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smdt1Q9DB10 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smdt1Q9DB10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smdt1Q9DB10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smdt1Q9DB10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smdt1Q9DB10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smdt1Q9DB10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smdt1Q9DB10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smdt1Q9DB10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smdt1Q9DB10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smdt1Q9DB10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smdt1Q9DB10 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smdt1Q9DB10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smdt1Q9DB10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smdt1Q9DB10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smdt1Q9DB10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smdt1Q9DB10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smdt1Q9DB10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smdt1Q9DB10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smdt1Q9DB10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smdt1Q9DB10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smdt1Q9DB10 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smdt1Q9DB10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smdt1Q9DB10 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smdt1Q9DB10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smdt1Q9DB10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smdt1Q9DB10 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smdt1Q9DB10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smdt1Q9DB10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smdt1Q9DB10 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smdt1Q9DB10 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smdt1Q9DB10 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smdt1Q9DB10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smdt1Q9DB10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smdt1Q9DB10 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smdt1Q9DB10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smdt1Q9DB10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smdt1Q9DB10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smdt1Q9DB10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smdt1Q9DB10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smdt1Q9DB10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smdt1Q9DB10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smdt1Q9DB10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smdt1Q9DB10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smdt1Q9DB10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smdt1Q9DB10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smdt1Q9DB10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smdt1Q9DB10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smdt1Q9DB10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Smdt1Q9DB10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smdt1Q9DB10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smdt1Q9DB10 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smdt1Q9DB10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smdt1Q9DB10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms