Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cmtm2aQ9DAR1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cmtm2aQ9DAR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cmtm2aQ9DAR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtm2aQ9DAR1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cmtm2aQ9DAR1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cmtm2aQ9DAR1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cmtm2aQ9DAR1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cmtm2aQ9DAR1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtm2aQ9DAR1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm2aQ9DAR1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtm2aQ9DAR1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtm2aQ9DAR1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm2aQ9DAR1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtm2aQ9DAR1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtm2aQ9DAR1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtm2aQ9DAR1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtm2aQ9DAR1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtm2aQ9DAR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtm2aQ9DAR1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmtm2aQ9DAR1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmtm2aQ9DAR1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtm2aQ9DAR1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmtm2aQ9DAR1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtm2aQ9DAR1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmtm2aQ9DAR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmtm2aQ9DAR1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmtm2aQ9DAR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cmtm2aQ9DAR1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmtm2aQ9DAR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmtm2aQ9DAR1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm2aQ9DAR1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtm2aQ9DAR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm2aQ9DAR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm2aQ9DAR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm2aQ9DAR1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm2aQ9DAR1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmtm2aQ9DAR1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm2aQ9DAR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm2aQ9DAR1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm2aQ9DAR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtm2aQ9DAR1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtm2aQ9DAR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cmtm2aQ9DAR1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtm2aQ9DAR1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtm2aQ9DAR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmtm2aQ9DAR1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cmtm2aQ9DAR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cmtm2aQ9DAR1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms