Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Efhd1Q9D4J1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Efhd1Q9D4J1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Efhd1Q9D4J1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Efhd1Q9D4J1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Efhd1Q9D4J1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Efhd1Q9D4J1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Efhd1Q9D4J1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Efhd1Q9D4J1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Efhd1Q9D4J1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Efhd1Q9D4J1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Efhd1Q9D4J1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Efhd1Q9D4J1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Efhd1Q9D4J1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Efhd1Q9D4J1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Efhd1Q9D4J1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Efhd1Q9D4J1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Efhd1Q9D4J1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Efhd1Q9D4J1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Efhd1Q9D4J1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Efhd1Q9D4J1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Efhd1Q9D4J1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Efhd1Q9D4J1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Efhd1Q9D4J1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Efhd1Q9D4J1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Efhd1Q9D4J1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Efhd1Q9D4J1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Efhd1Q9D4J1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Efhd1Q9D4J1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Efhd1Q9D4J1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Efhd1Q9D4J1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Efhd1Q9D4J1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Efhd1Q9D4J1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Efhd1Q9D4J1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Efhd1Q9D4J1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Efhd1Q9D4J1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Efhd1Q9D4J1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Efhd1Q9D4J1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Efhd1Q9D4J1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Efhd1Q9D4J1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Efhd1Q9D4J1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Efhd1Q9D4J1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Efhd1Q9D4J1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Efhd1Q9D4J1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Efhd1Q9D4J1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Efhd1Q9D4J1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Efhd1Q9D4J1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Efhd1Q9D4J1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Efhd1Q9D4J1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Efhd1Q9D4J1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Efhd1Q9D4J1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Efhd1Q9D4J1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Efhd1Q9D4J1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Efhd1Q9D4J1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Efhd1Q9D4J1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Efhd1Q9D4J1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Efhd1Q9D4J1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Efhd1Q9D4J1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Efhd1Q9D4J1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Efhd1Q9D4J1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Efhd1Q9D4J1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Efhd1Q9D4J1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Efhd1Q9D4J1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Efhd1Q9D4J1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Efhd1Q9D4J1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Efhd1Q9D4J1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Efhd1Q9D4J1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Efhd1Q9D4J1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Efhd1Q9D4J1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Efhd1Q9D4J1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Efhd1Q9D4J1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Efhd1Q9D4J1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Efhd1Q9D4J1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Efhd1Q9D4J1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Efhd1Q9D4J1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Efhd1Q9D4J1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Efhd1Q9D4J1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Efhd1Q9D4J1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Efhd1Q9D4J1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Efhd1Q9D4J1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Efhd1Q9D4J1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Efhd1Q9D4J1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Efhd1Q9D4J1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Efhd1Q9D4J1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Efhd1Q9D4J1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Efhd1Q9D4J1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Efhd1Q9D4J1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Efhd1Q9D4J1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Efhd1Q9D4J1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms