Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc47Q9D024 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc47Q9D024 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc47Q9D024 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc47Q9D024 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc47Q9D024 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc47Q9D024 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc47Q9D024 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc47Q9D024 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ccdc47Q9D024 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc47Q9D024 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc47Q9D024 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc47Q9D024 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc47Q9D024 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc47Q9D024 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc47Q9D024 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc47Q9D024 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc47Q9D024 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc47Q9D024 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc47Q9D024 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc47Q9D024 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccdc47Q9D024 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ccdc47Q9D024 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ccdc47Q9D024 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ccdc47Q9D024 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ccdc47Q9D024 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc47Q9D024 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc47Q9D024 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ccdc47Q9D024 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc47Q9D024 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc47Q9D024 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Ccdc47Q9D024 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ccdc47Q9D024 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc47Q9D024 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc47Q9D024 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc47Q9D024 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc47Q9D024 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc47Q9D024 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc47Q9D024 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc47Q9D024 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc47Q9D024 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc47Q9D024 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc47Q9D024 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc47Q9D024 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc47Q9D024 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc47Q9D024 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccdc47Q9D024 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ccdc47Q9D024 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc47Q9D024 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc47Q9D024 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ccdc47Q9D024 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc47Q9D024 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc47Q9D024 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc47Q9D024 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc47Q9D024 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc47Q9D024 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc47Q9D024 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc47Q9D024 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc47Q9D024 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc47Q9D024 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc47Q9D024 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc47Q9D024 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc47Q9D024 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc47Q9D024 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc47Q9D024 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc47Q9D024 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc47Q9D024 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc47Q9D024 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc47Q9D024 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccdc47Q9D024 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc47Q9D024 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc47Q9D024 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ccdc47Q9D024 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc47Q9D024 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc47Q9D024 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc47Q9D024 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccdc47Q9D024 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc47Q9D024 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc47Q9D024 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc47Q9D024 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc47Q9D024 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc47Q9D024 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc47Q9D024 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc47Q9D024 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc47Q9D024 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms