Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Thumpd2Q9CZB3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Thumpd2Q9CZB3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Thumpd2Q9CZB3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Thumpd2Q9CZB3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Thumpd2Q9CZB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Thumpd2Q9CZB3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Thumpd2Q9CZB3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Thumpd2Q9CZB3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Thumpd2Q9CZB3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Thumpd2Q9CZB3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Thumpd2Q9CZB3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Thumpd2Q9CZB3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Thumpd2Q9CZB3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Thumpd2Q9CZB3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Thumpd2Q9CZB3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Thumpd2Q9CZB3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Thumpd2Q9CZB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thumpd2Q9CZB3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Thumpd2Q9CZB3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Thumpd2Q9CZB3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Thumpd2Q9CZB3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Thumpd2Q9CZB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thumpd2Q9CZB3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Thumpd2Q9CZB3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Thumpd2Q9CZB3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Thumpd2Q9CZB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Thumpd2Q9CZB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Thumpd2Q9CZB3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Thumpd2Q9CZB3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Thumpd2Q9CZB3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Thumpd2Q9CZB3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Thumpd2Q9CZB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Thumpd2Q9CZB3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Thumpd2Q9CZB3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Thumpd2Q9CZB3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Thumpd2Q9CZB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Thumpd2Q9CZB3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Thumpd2Q9CZB3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Thumpd2Q9CZB3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Thumpd2Q9CZB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Thumpd2Q9CZB3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Thumpd2Q9CZB3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Thumpd2Q9CZB3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Thumpd2Q9CZB3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Thumpd2Q9CZB3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Thumpd2Q9CZB3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Thumpd2Q9CZB3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Thumpd2Q9CZB3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Thumpd2Q9CZB3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thumpd2Q9CZB3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Thumpd2Q9CZB3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Thumpd2Q9CZB3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Thumpd2Q9CZB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Thumpd2Q9CZB3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Thumpd2Q9CZB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Thumpd2Q9CZB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Thumpd2Q9CZB3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Thumpd2Q9CZB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Thumpd2Q9CZB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Thumpd2Q9CZB3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Thumpd2Q9CZB3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Thumpd2Q9CZB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Thumpd2Q9CZB3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Thumpd2Q9CZB3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Thumpd2Q9CZB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Thumpd2Q9CZB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Thumpd2Q9CZB3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thumpd2Q9CZB3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms