Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ist1Q9CX00 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ist1Q9CX00 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ist1Q9CX00 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ist1Q9CX00 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ist1Q9CX00 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ist1Q9CX00 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ist1Q9CX00 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ist1Q9CX00 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ist1Q9CX00 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ist1Q9CX00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ist1Q9CX00 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ist1Q9CX00 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ist1Q9CX00 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ist1Q9CX00 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ist1Q9CX00 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ist1Q9CX00 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ist1Q9CX00 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ist1Q9CX00 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ist1Q9CX00 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ist1Q9CX00 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ist1Q9CX00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ist1Q9CX00 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ist1Q9CX00 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ist1Q9CX00 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ist1Q9CX00 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ist1Q9CX00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ist1Q9CX00 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ist1Q9CX00 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ist1Q9CX00 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ist1Q9CX00 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ist1Q9CX00 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ist1Q9CX00 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ist1Q9CX00 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ist1Q9CX00 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ist1Q9CX00 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ist1Q9CX00 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ist1Q9CX00 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ist1Q9CX00 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ist1Q9CX00 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ist1Q9CX00 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ist1Q9CX00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ist1Q9CX00 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ist1Q9CX00 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ist1Q9CX00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ist1Q9CX00 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ist1Q9CX00 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ist1Q9CX00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ist1Q9CX00 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ist1Q9CX00 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ist1Q9CX00 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ist1Q9CX00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ist1Q9CX00 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ist1Q9CX00 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ist1Q9CX00 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ist1Q9CX00 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ist1Q9CX00 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ist1Q9CX00 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ist1Q9CX00 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ist1Q9CX00 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ist1Q9CX00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ist1Q9CX00 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ist1Q9CX00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ist1Q9CX00 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ist1Q9CX00 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ist1Q9CX00 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ist1Q9CX00 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ist1Q9CX00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ist1Q9CX00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ist1Q9CX00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ist1Q9CX00 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ist1Q9CX00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ist1Q9CX00 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ist1Q9CX00 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ist1Q9CX00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ist1Q9CX00 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ist1Q9CX00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ist1Q9CX00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms