Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab29Q91YQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab29Q91YQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab29Q91YQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab29Q91YQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab29Q91YQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab29Q91YQ1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab29Q91YQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab29Q91YQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab29Q91YQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab29Q91YQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab29Q91YQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab29Q91YQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab29Q91YQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab29Q91YQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab29Q91YQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab29Q91YQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab29Q91YQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab29Q91YQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab29Q91YQ1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab29Q91YQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab29Q91YQ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab29Q91YQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab29Q91YQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab29Q91YQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab29Q91YQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab29Q91YQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab29Q91YQ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab29Q91YQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab29Q91YQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab29Q91YQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab29Q91YQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab29Q91YQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab29Q91YQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab29Q91YQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab29Q91YQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab29Q91YQ1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab29Q91YQ1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab29Q91YQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab29Q91YQ1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab29Q91YQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab29Q91YQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab29Q91YQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab29Q91YQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab29Q91YQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab29Q91YQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab29Q91YQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab29Q91YQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab29Q91YQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rab29Q91YQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab29Q91YQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab29Q91YQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab29Q91YQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab29Q91YQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab29Q91YQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms