Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usb1Q91W78 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usb1Q91W78 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usb1Q91W78 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usb1Q91W78 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Usb1Q91W78 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usb1Q91W78 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usb1Q91W78 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usb1Q91W78 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usb1Q91W78 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usb1Q91W78 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usb1Q91W78 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usb1Q91W78 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usb1Q91W78 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usb1Q91W78 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usb1Q91W78 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usb1Q91W78 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usb1Q91W78 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usb1Q91W78 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usb1Q91W78 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usb1Q91W78 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usb1Q91W78 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usb1Q91W78 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usb1Q91W78 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usb1Q91W78 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usb1Q91W78 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usb1Q91W78 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usb1Q91W78 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usb1Q91W78 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usb1Q91W78 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usb1Q91W78 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usb1Q91W78 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usb1Q91W78 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usb1Q91W78 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usb1Q91W78 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usb1Q91W78 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usb1Q91W78 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usb1Q91W78 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usb1Q91W78 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usb1Q91W78 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usb1Q91W78 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Usb1Q91W78 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Usb1Q91W78 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usb1Q91W78 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usb1Q91W78 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usb1Q91W78 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usb1Q91W78 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usb1Q91W78 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usb1Q91W78 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usb1Q91W78 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usb1Q91W78 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Usb1Q91W78 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usb1Q91W78 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usb1Q91W78 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usb1Q91W78 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Usb1Q91W78 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usb1Q91W78 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usb1Q91W78 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usb1Q91W78 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usb1Q91W78 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usb1Q91W78 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usb1Q91W78 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usb1Q91W78 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usb1Q91W78 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Usb1Q91W78 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usb1Q91W78 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usb1Q91W78 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usb1Q91W78 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usb1Q91W78 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usb1Q91W78 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usb1Q91W78 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usb1Q91W78 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usb1Q91W78 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usb1Q91W78 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usb1Q91W78 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usb1Q91W78 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usb1Q91W78 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usb1Q91W78 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usb1Q91W78 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usb1Q91W78 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usb1Q91W78 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usb1Q91W78 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usb1Q91W78 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usb1Q91W78 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usb1Q91W78 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usb1Q91W78 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usb1Q91W78 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usb1Q91W78 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usb1Q91W78 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usb1Q91W78 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usb1Q91W78 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Usb1Q91W78 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms