Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc58Q8R3Q6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc58Q8R3Q6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc58Q8R3Q6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc58Q8R3Q6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc58Q8R3Q6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc58Q8R3Q6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc58Q8R3Q6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc58Q8R3Q6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc58Q8R3Q6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc58Q8R3Q6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc58Q8R3Q6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc58Q8R3Q6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc58Q8R3Q6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc58Q8R3Q6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc58Q8R3Q6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc58Q8R3Q6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc58Q8R3Q6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc58Q8R3Q6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc58Q8R3Q6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc58Q8R3Q6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc58Q8R3Q6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc58Q8R3Q6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc58Q8R3Q6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc58Q8R3Q6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc58Q8R3Q6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc58Q8R3Q6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc58Q8R3Q6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc58Q8R3Q6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc58Q8R3Q6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc58Q8R3Q6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc58Q8R3Q6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc58Q8R3Q6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc58Q8R3Q6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc58Q8R3Q6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc58Q8R3Q6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc58Q8R3Q6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc58Q8R3Q6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc58Q8R3Q6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc58Q8R3Q6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc58Q8R3Q6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc58Q8R3Q6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc58Q8R3Q6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc58Q8R3Q6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc58Q8R3Q6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc58Q8R3Q6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc58Q8R3Q6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc58Q8R3Q6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc58Q8R3Q6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc58Q8R3Q6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc58Q8R3Q6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms