Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ube2q2Q8K2Z8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ube2q2Q8K2Z8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ube2q2Q8K2Z8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ube2q2Q8K2Z8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube2q2Q8K2Z8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ube2q2Q8K2Z8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ube2q2Q8K2Z8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ube2q2Q8K2Z8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ube2q2Q8K2Z8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ube2q2Q8K2Z8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ube2q2Q8K2Z8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ube2q2Q8K2Z8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ube2q2Q8K2Z8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ube2q2Q8K2Z8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ube2q2Q8K2Z8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ube2q2Q8K2Z8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ube2q2Q8K2Z8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ube2q2Q8K2Z8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ube2q2Q8K2Z8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ube2q2Q8K2Z8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2q2Q8K2Z8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2q2Q8K2Z8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2q2Q8K2Z8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2q2Q8K2Z8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2q2Q8K2Z8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2q2Q8K2Z8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2q2Q8K2Z8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ube2q2Q8K2Z8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ube2q2Q8K2Z8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ube2q2Q8K2Z8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ube2q2Q8K2Z8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ube2q2Q8K2Z8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ube2q2Q8K2Z8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ube2q2Q8K2Z8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ube2q2Q8K2Z8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube2q2Q8K2Z8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube2q2Q8K2Z8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ube2q2Q8K2Z8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ube2q2Q8K2Z8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ube2q2Q8K2Z8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ube2q2Q8K2Z8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ube2q2Q8K2Z8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2q2Q8K2Z8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2q2Q8K2Z8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2q2Q8K2Z8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ube2q2Q8K2Z8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ube2q2Q8K2Z8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ube2q2Q8K2Z8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ube2q2Q8K2Z8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ube2q2Q8K2Z8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2q2Q8K2Z8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ube2q2Q8K2Z8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ube2q2Q8K2Z8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ube2q2Q8K2Z8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ube2q2Q8K2Z8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube2q2Q8K2Z8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube2q2Q8K2Z8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ube2q2Q8K2Z8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ube2q2Q8K2Z8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ube2q2Q8K2Z8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ube2q2Q8K2Z8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ube2q2Q8K2Z8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ube2q2Q8K2Z8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ube2q2Q8K2Z8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ube2q2Q8K2Z8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ube2q2Q8K2Z8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube2q2Q8K2Z8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube2q2Q8K2Z8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ube2q2Q8K2Z8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ube2q2Q8K2Z8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ube2q2Q8K2Z8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms