Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ccdc30Q8BVF4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccdc30Q8BVF4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Ccdc30Q8BVF4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ccdc30Q8BVF4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ccdc30Q8BVF4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ccdc30Q8BVF4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ccdc30Q8BVF4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ccdc30Q8BVF4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ccdc30Q8BVF4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Ccdc30Q8BVF4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ccdc30Q8BVF4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ccdc30Q8BVF4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ccdc30Q8BVF4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ccdc30Q8BVF4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ccdc30Q8BVF4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ccdc30Q8BVF4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ccdc30Q8BVF4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ccdc30Q8BVF4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ccdc30Q8BVF4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ccdc30Q8BVF4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc30Q8BVF4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ccdc30Q8BVF4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Ccdc30Q8BVF4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ccdc30Q8BVF4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ccdc30Q8BVF4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ccdc30Q8BVF4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Ccdc30Q8BVF4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc30Q8BVF4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc30Q8BVF4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc30Q8BVF4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc30Q8BVF4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc30Q8BVF4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ccdc30Q8BVF4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ccdc30Q8BVF4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ccdc30Q8BVF4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc30Q8BVF4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ccdc30Q8BVF4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ccdc30Q8BVF4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc30Q8BVF4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ccdc30Q8BVF4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ccdc30Q8BVF4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Ccdc30Q8BVF4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc30Q8BVF4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Ccdc30Q8BVF4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ccdc30Q8BVF4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ccdc30Q8BVF4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ccdc30Q8BVF4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc30Q8BVF4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc30Q8BVF4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ccdc30Q8BVF4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Ccdc30Q8BVF4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc30Q8BVF4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Ccdc30Q8BVF4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Ccdc30Q8BVF4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc30Q8BVF4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc30Q8BVF4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc30Q8BVF4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc30Q8BVF4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc30Q8BVF4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc30Q8BVF4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc30Q8BVF4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc30Q8BVF4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc30Q8BVF4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc30Q8BVF4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc30Q8BVF4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ccdc30Q8BVF4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc30Q8BVF4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ccdc30Q8BVF4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ccdc30Q8BVF4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc30Q8BVF4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc30Q8BVF4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc30Q8BVF4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccdc30Q8BVF4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc30Q8BVF4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc30Q8BVF4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc30Q8BVF4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc30Q8BVF4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms