Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klhl38Q8BSF5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhl38Q8BSF5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl38Q8BSF5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Klhl38Q8BSF5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Klhl38Q8BSF5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl38Q8BSF5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl38Q8BSF5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Klhl38Q8BSF5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Klhl38Q8BSF5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Klhl38Q8BSF5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Klhl38Q8BSF5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klhl38Q8BSF5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Klhl38Q8BSF5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klhl38Q8BSF5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Klhl38Q8BSF5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Klhl38Q8BSF5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Klhl38Q8BSF5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Klhl38Q8BSF5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl38Q8BSF5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl38Q8BSF5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Klhl38Q8BSF5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Klhl38Q8BSF5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Klhl38Q8BSF5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Klhl38Q8BSF5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klhl38Q8BSF5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Klhl38Q8BSF5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Klhl38Q8BSF5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Klhl38Q8BSF5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Klhl38Q8BSF5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Klhl38Q8BSF5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klhl38Q8BSF5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Klhl38Q8BSF5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klhl38Q8BSF5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Klhl38Q8BSF5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klhl38Q8BSF5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhl38Q8BSF5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl38Q8BSF5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl38Q8BSF5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Klhl38Q8BSF5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Klhl38Q8BSF5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klhl38Q8BSF5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl38Q8BSF5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl38Q8BSF5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Klhl38Q8BSF5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Klhl38Q8BSF5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Klhl38Q8BSF5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Klhl38Q8BSF5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Klhl38Q8BSF5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klhl38Q8BSF5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Klhl38Q8BSF5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl38Q8BSF5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl38Q8BSF5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Klhl38Q8BSF5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Klhl38Q8BSF5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl38Q8BSF5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl38Q8BSF5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klhl38Q8BSF5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhl38Q8BSF5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl38Q8BSF5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl38Q8BSF5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl38Q8BSF5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl38Q8BSF5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl38Q8BSF5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl38Q8BSF5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms