Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna12Q80SS5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifna12Q80SS5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifna12Q80SS5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifna12Q80SS5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna12Q80SS5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna12Q80SS5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifna12Q80SS5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifna12Q80SS5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna12Q80SS5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifna12Q80SS5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifna12Q80SS5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna12Q80SS5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna12Q80SS5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna12Q80SS5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna12Q80SS5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna12Q80SS5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna12Q80SS5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna12Q80SS5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna12Q80SS5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifna12Q80SS5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifna12Q80SS5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifna12Q80SS5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna12Q80SS5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifna12Q80SS5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifna12Q80SS5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifna12Q80SS5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna12Q80SS5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifna12Q80SS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna12Q80SS5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifna12Q80SS5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifna12Q80SS5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifna12Q80SS5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna12Q80SS5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifna12Q80SS5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna12Q80SS5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ifna12Q80SS5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna12Q80SS5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifna12Q80SS5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna12Q80SS5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifna12Q80SS5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifna12Q80SS5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifna12Q80SS5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifna12Q80SS5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifna12Q80SS5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ifna12Q80SS5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna12Q80SS5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifna12Q80SS5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifna12Q80SS5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna12Q80SS5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna12Q80SS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifna12Q80SS5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifna12Q80SS5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifna12Q80SS5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifna12Q80SS5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifna12Q80SS5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifna12Q80SS5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifna12Q80SS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifna12Q80SS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifna12Q80SS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms