Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPF4

Fmnl3, Formin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmnl3Q6ZPF4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Fmnl3Q6ZPF4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fmnl3Q6ZPF4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fmnl3Q6ZPF4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fmnl3Q6ZPF4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmnl3Q6ZPF4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmnl3Q6ZPF4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Fmnl3Q6ZPF4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fmnl3Q6ZPF4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmnl3Q6ZPF4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fmnl3Q6ZPF4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Fmnl3Q6ZPF4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fmnl3Q6ZPF4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Fmnl3Q6ZPF4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fmnl3Q6ZPF4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fmnl3Q6ZPF4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Fmnl3Q6ZPF4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fmnl3Q6ZPF4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Fmnl3Q6ZPF4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Fmnl3Q6ZPF4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fmnl3Q6ZPF4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fmnl3Q6ZPF4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fmnl3Q6ZPF4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fmnl3Q6ZPF4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Fmnl3Q6ZPF4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fmnl3Q6ZPF4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fmnl3Q6ZPF4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fmnl3Q6ZPF4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fmnl3Q6ZPF4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fmnl3Q6ZPF4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fmnl3Q6ZPF4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fmnl3Q6ZPF4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fmnl3Q6ZPF4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fmnl3Q6ZPF4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fmnl3Q6ZPF4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Fmnl3Q6ZPF4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Fmnl3Q6ZPF4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fmnl3Q6ZPF4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Fmnl3Q6ZPF4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fmnl3Q6ZPF4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fmnl3Q6ZPF4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fmnl3Q6ZPF4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fmnl3Q6ZPF4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fmnl3Q6ZPF4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fmnl3Q6ZPF4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fmnl3Q6ZPF4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmnl3Q6ZPF4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fmnl3Q6ZPF4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fmnl3Q6ZPF4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fmnl3Q6ZPF4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fmnl3Q6ZPF4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fmnl3Q6ZPF4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmnl3Q6ZPF4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmnl3Q6ZPF4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fmnl3Q6ZPF4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fmnl3Q6ZPF4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fmnl3Q6ZPF4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmnl3Q6ZPF4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fmnl3Q6ZPF4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmnl3Q6ZPF4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmnl3Q6ZPF4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fmnl3Q6ZPF4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Fmnl3Q6ZPF4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fmnl3Q6ZPF4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fmnl3Q6ZPF4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fmnl3Q6ZPF4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmnl3Q6ZPF4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fmnl3Q6ZPF4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fmnl3Q6ZPF4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fmnl3Q6ZPF4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fmnl3Q6ZPF4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Fmnl3Q6ZPF4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmnl3Q6ZPF4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmnl3Q6ZPF4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmnl3Q6ZPF4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fmnl3Q6ZPF4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fmnl3Q6ZPF4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fmnl3Q6ZPF4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fmnl3Q6ZPF4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fmnl3Q6ZPF4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms