Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc154Q6RUT8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc154Q6RUT8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc154Q6RUT8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc154Q6RUT8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc154Q6RUT8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc154Q6RUT8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc154Q6RUT8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc154Q6RUT8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc154Q6RUT8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc154Q6RUT8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc154Q6RUT8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc154Q6RUT8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc154Q6RUT8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc154Q6RUT8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc154Q6RUT8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc154Q6RUT8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc154Q6RUT8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc154Q6RUT8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc154Q6RUT8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc154Q6RUT8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc154Q6RUT8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc154Q6RUT8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc154Q6RUT8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc154Q6RUT8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc154Q6RUT8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc154Q6RUT8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc154Q6RUT8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc154Q6RUT8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc154Q6RUT8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc154Q6RUT8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc154Q6RUT8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc154Q6RUT8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc154Q6RUT8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc154Q6RUT8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc154Q6RUT8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc154Q6RUT8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc154Q6RUT8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc154Q6RUT8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc154Q6RUT8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc154Q6RUT8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc154Q6RUT8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc154Q6RUT8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc154Q6RUT8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc154Q6RUT8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc154Q6RUT8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc154Q6RUT8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc154Q6RUT8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc154Q6RUT8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc154Q6RUT8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc154Q6RUT8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc154Q6RUT8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc154Q6RUT8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc154Q6RUT8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc154Q6RUT8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc154Q6RUT8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc154Q6RUT8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc154Q6RUT8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc154Q6RUT8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc154Q6RUT8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc154Q6RUT8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc154Q6RUT8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc154Q6RUT8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc154Q6RUT8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc154Q6RUT8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc154Q6RUT8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc154Q6RUT8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc154Q6RUT8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.3 ms