Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Q6PD19 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Q6PD19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Q6PD19 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Q6PD19 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Q6PD19 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Q6PD19 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Q6PD19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Q6PD19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Q6PD19 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q6PD19 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q6PD19 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q6PD19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q6PD19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q6PD19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q6PD19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q6PD19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Q6PD19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q6PD19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q6PD19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q6PD19 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q6PD19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q6PD19 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q6PD19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q6PD19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Q6PD19 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Q6PD19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q6PD19 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q6PD19 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Q6PD19 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q6PD19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q6PD19 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Q6PD19 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q6PD19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q6PD19 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q6PD19 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q6PD19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q6PD19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q6PD19 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q6PD19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q6PD19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q6PD19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q6PD19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Q6PD19 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Q6PD19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q6PD19 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Q6PD19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Q6PD19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Q6PD19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Q6PD19 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Q6PD19 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Q6PD19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Q6PD19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Q6PD19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Q6PD19 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Q6PD19 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q6PD19 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Q6PD19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q6PD19 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q6PD19 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q6PD19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q6PD19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q6PD19 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q6PD19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q6PD19 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q6PD19 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q6PD19 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q6PD19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q6PD19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Q6PD19 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q6PD19 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q6PD19 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q6PD19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q6PD19 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q6PD19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q6PD19 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q6PD19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q6PD19 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q6PD19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q6PD19 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q6PD19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Q6PD19 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q6PD19 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q6PD19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q6PD19 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q6PD19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q6PD19 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Q6PD19 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q6PD19 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Q6PD19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Q6PD19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q6PD19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Q6PD19 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Q6PD19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q6PD19 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q6PD19 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Q6PD19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Q6PD19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Q6PD19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Q6PD19 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms