Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc117Q6PB51 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc117Q6PB51 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc117Q6PB51 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc117Q6PB51 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc117Q6PB51 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc117Q6PB51 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc117Q6PB51 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc117Q6PB51 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc117Q6PB51 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc117Q6PB51 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc117Q6PB51 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc117Q6PB51 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc117Q6PB51 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc117Q6PB51 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc117Q6PB51 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc117Q6PB51 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc117Q6PB51 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc117Q6PB51 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc117Q6PB51 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc117Q6PB51 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc117Q6PB51 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc117Q6PB51 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc117Q6PB51 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc117Q6PB51 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc117Q6PB51 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc117Q6PB51 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc117Q6PB51 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc117Q6PB51 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc117Q6PB51 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc117Q6PB51 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc117Q6PB51 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc117Q6PB51 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc117Q6PB51 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc117Q6PB51 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc117Q6PB51 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc117Q6PB51 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc117Q6PB51 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc117Q6PB51 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc117Q6PB51 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc117Q6PB51 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc117Q6PB51 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc117Q6PB51 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc117Q6PB51 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc117Q6PB51 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc117Q6PB51 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc117Q6PB51 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc117Q6PB51 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc117Q6PB51 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc117Q6PB51 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc117Q6PB51 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc117Q6PB51 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc117Q6PB51 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc117Q6PB51 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc117Q6PB51 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc117Q6PB51 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc117Q6PB51 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc117Q6PB51 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc117Q6PB51 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc117Q6PB51 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc117Q6PB51 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc117Q6PB51 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc117Q6PB51 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc117Q6PB51 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc117Q6PB51 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc117Q6PB51 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc117Q6PB51 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc117Q6PB51 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc117Q6PB51 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc117Q6PB51 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc117Q6PB51 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc117Q6PB51 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc117Q6PB51 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms