Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarcd3Q6P9Z1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarcd3Q6P9Z1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarcd3Q6P9Z1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarcd3Q6P9Z1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarcd3Q6P9Z1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarcd3Q6P9Z1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarcd3Q6P9Z1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcd3Q6P9Z1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcd3Q6P9Z1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcd3Q6P9Z1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarcd3Q6P9Z1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcd3Q6P9Z1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcd3Q6P9Z1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcd3Q6P9Z1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcd3Q6P9Z1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcd3Q6P9Z1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcd3Q6P9Z1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcd3Q6P9Z1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcd3Q6P9Z1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcd3Q6P9Z1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcd3Q6P9Z1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcd3Q6P9Z1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcd3Q6P9Z1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcd3Q6P9Z1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcd3Q6P9Z1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd3Q6P9Z1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd3Q6P9Z1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd3Q6P9Z1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcd3Q6P9Z1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcd3Q6P9Z1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcd3Q6P9Z1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcd3Q6P9Z1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcd3Q6P9Z1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarcd3Q6P9Z1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarcd3Q6P9Z1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcd3Q6P9Z1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarcd3Q6P9Z1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcd3Q6P9Z1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarcd3Q6P9Z1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarcd3Q6P9Z1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarcd3Q6P9Z1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcd3Q6P9Z1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smarcd3Q6P9Z1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcd3Q6P9Z1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarcd3Q6P9Z1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcd3Q6P9Z1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcd3Q6P9Z1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcd3Q6P9Z1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcd3Q6P9Z1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcd3Q6P9Z1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcd3Q6P9Z1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcd3Q6P9Z1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcd3Q6P9Z1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcd3Q6P9Z1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcd3Q6P9Z1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcd3Q6P9Z1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd3Q6P9Z1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcd3Q6P9Z1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcd3Q6P9Z1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcd3Q6P9Z1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcd3Q6P9Z1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcd3Q6P9Z1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcd3Q6P9Z1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcd3Q6P9Z1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcd3Q6P9Z1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd3Q6P9Z1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcd3Q6P9Z1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcd3Q6P9Z1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcd3Q6P9Z1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd3Q6P9Z1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd3Q6P9Z1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcd3Q6P9Z1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smarcd3Q6P9Z1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms