Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nlrp4eQ66X19 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nlrp4eQ66X19 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nlrp4eQ66X19 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nlrp4eQ66X19 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nlrp4eQ66X19 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nlrp4eQ66X19 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nlrp4eQ66X19 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nlrp4eQ66X19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nlrp4eQ66X19 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nlrp4eQ66X19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nlrp4eQ66X19 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nlrp4eQ66X19 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nlrp4eQ66X19 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nlrp4eQ66X19 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlrp4eQ66X19 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlrp4eQ66X19 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlrp4eQ66X19 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nlrp4eQ66X19 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nlrp4eQ66X19 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nlrp4eQ66X19 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nlrp4eQ66X19 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nlrp4eQ66X19 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nlrp4eQ66X19 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nlrp4eQ66X19 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nlrp4eQ66X19 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nlrp4eQ66X19 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp4eQ66X19 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp4eQ66X19 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp4eQ66X19 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp4eQ66X19 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp4eQ66X19 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp4eQ66X19 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlrp4eQ66X19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nlrp4eQ66X19 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nlrp4eQ66X19 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nlrp4eQ66X19 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms