Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifna15Q61718 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifna15Q61718 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifna15Q61718 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifna15Q61718 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna15Q61718 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna15Q61718 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna15Q61718 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ifna15Q61718 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifna15Q61718 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifna15Q61718 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifna15Q61718 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifna15Q61718 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ifna15Q61718 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifna15Q61718 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifna15Q61718 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ifna15Q61718 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifna15Q61718 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifna15Q61718 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifna15Q61718 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ifna15Q61718 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifna15Q61718 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifna15Q61718 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ifna15Q61718 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifna15Q61718 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifna15Q61718 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifna15Q61718 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifna15Q61718 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifna15Q61718 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifna15Q61718 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifna15Q61718 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifna15Q61718 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna15Q61718 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifna15Q61718 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifna15Q61718 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifna15Q61718 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifna15Q61718 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifna15Q61718 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifna15Q61718 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifna15Q61718 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifna15Q61718 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifna15Q61718 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifna15Q61718 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifna15Q61718 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifna15Q61718 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifna15Q61718 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifna15Q61718 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna15Q61718 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifna15Q61718 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifna15Q61718 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifna15Q61718 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifna15Q61718 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifna15Q61718 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifna15Q61718 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifna15Q61718 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna15Q61718 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna15Q61718 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna15Q61718 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna15Q61718 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna15Q61718 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna15Q61718 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifna15Q61718 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ifna15Q61718 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifna15Q61718 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifna15Q61718 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifna15Q61718 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifna15Q61718 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms