Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd53Q61451 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd53Q61451 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd53Q61451 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd53Q61451 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd53Q61451 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd53Q61451 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cd53Q61451 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd53Q61451 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd53Q61451 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd53Q61451 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd53Q61451 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd53Q61451 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd53Q61451 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd53Q61451 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd53Q61451 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd53Q61451 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd53Q61451 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd53Q61451 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd53Q61451 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd53Q61451 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd53Q61451 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd53Q61451 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd53Q61451 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd53Q61451 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd53Q61451 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd53Q61451 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd53Q61451 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd53Q61451 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd53Q61451 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd53Q61451 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd53Q61451 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd53Q61451 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd53Q61451 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd53Q61451 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd53Q61451 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd53Q61451 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd53Q61451 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cd53Q61451 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd53Q61451 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd53Q61451 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd53Q61451 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd53Q61451 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd53Q61451 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd53Q61451 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd53Q61451 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd53Q61451 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd53Q61451 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd53Q61451 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd53Q61451 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd53Q61451 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd53Q61451 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd53Q61451 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd53Q61451 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd53Q61451 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd53Q61451 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd53Q61451 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd53Q61451 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd53Q61451 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd53Q61451 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd53Q61451 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd53Q61451 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd53Q61451 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd53Q61451 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd53Q61451 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd53Q61451 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd53Q61451 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd53Q61451 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd53Q61451 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms