Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Foxd4Q60688 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Foxd4Q60688 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Foxd4Q60688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Foxd4Q60688 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Foxd4Q60688 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Foxd4Q60688 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Foxd4Q60688 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Foxd4Q60688 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Foxd4Q60688 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Foxd4Q60688 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Foxd4Q60688 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Foxd4Q60688 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Foxd4Q60688 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Foxd4Q60688 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Foxd4Q60688 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Foxd4Q60688 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Foxd4Q60688 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Foxd4Q60688 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Foxd4Q60688 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Foxd4Q60688 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Foxd4Q60688 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Foxd4Q60688 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Foxd4Q60688 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Foxd4Q60688 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Foxd4Q60688 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Foxd4Q60688 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Foxd4Q60688 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Foxd4Q60688 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Foxd4Q60688 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Foxd4Q60688 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Foxd4Q60688 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Foxd4Q60688 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Foxd4Q60688 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Foxd4Q60688 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd4Q60688 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Foxd4Q60688 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Foxd4Q60688 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxd4Q60688 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxd4Q60688 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxd4Q60688 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxd4Q60688 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxd4Q60688 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxd4Q60688 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd4Q60688 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxd4Q60688 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxd4Q60688 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxd4Q60688 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxd4Q60688 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxd4Q60688 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Foxd4Q60688 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Foxd4Q60688 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Foxd4Q60688 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Foxd4Q60688 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Foxd4Q60688 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Foxd4Q60688 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Foxd4Q60688 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Foxd4Q60688 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Foxd4Q60688 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Foxd4Q60688 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Foxd4Q60688 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd4Q60688 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Foxd4Q60688 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Foxd4Q60688 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Foxd4Q60688 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Foxd4Q60688 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Foxd4Q60688 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Foxd4Q60688 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Foxd4Q60688 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Foxd4Q60688 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Foxd4Q60688 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 652.7 ms