Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Afap1l2Q5DTU0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Afap1l2Q5DTU0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Afap1l2Q5DTU0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Afap1l2Q5DTU0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Afap1l2Q5DTU0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Afap1l2Q5DTU0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Afap1l2Q5DTU0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Afap1l2Q5DTU0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Afap1l2Q5DTU0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Afap1l2Q5DTU0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Afap1l2Q5DTU0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Afap1l2Q5DTU0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Afap1l2Q5DTU0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Afap1l2Q5DTU0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Afap1l2Q5DTU0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Afap1l2Q5DTU0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Afap1l2Q5DTU0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Afap1l2Q5DTU0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Afap1l2Q5DTU0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Afap1l2Q5DTU0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Afap1l2Q5DTU0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Afap1l2Q5DTU0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Afap1l2Q5DTU0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Afap1l2Q5DTU0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Afap1l2Q5DTU0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Afap1l2Q5DTU0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Afap1l2Q5DTU0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Afap1l2Q5DTU0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Afap1l2Q5DTU0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Afap1l2Q5DTU0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Afap1l2Q5DTU0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Afap1l2Q5DTU0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Afap1l2Q5DTU0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Afap1l2Q5DTU0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Afap1l2Q5DTU0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Afap1l2Q5DTU0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Afap1l2Q5DTU0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Afap1l2Q5DTU0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Afap1l2Q5DTU0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afap1l2Q5DTU0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Afap1l2Q5DTU0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afap1l2Q5DTU0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Afap1l2Q5DTU0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Afap1l2Q5DTU0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Afap1l2Q5DTU0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Afap1l2Q5DTU0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Afap1l2Q5DTU0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Afap1l2Q5DTU0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Afap1l2Q5DTU0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Afap1l2Q5DTU0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Afap1l2Q5DTU0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Afap1l2Q5DTU0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Afap1l2Q5DTU0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Afap1l2Q5DTU0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Afap1l2Q5DTU0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Afap1l2Q5DTU0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Afap1l2Q5DTU0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Afap1l2Q5DTU0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Afap1l2Q5DTU0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Afap1l2Q5DTU0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Afap1l2Q5DTU0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Afap1l2Q5DTU0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Afap1l2Q5DTU0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Afap1l2Q5DTU0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Afap1l2Q5DTU0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Afap1l2Q5DTU0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Afap1l2Q5DTU0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Afap1l2Q5DTU0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Afap1l2Q5DTU0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Afap1l2Q5DTU0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Afap1l2Q5DTU0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Afap1l2Q5DTU0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Afap1l2Q5DTU0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Afap1l2Q5DTU0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Afap1l2Q5DTU0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms